【招标公告】宁德市疾病预防控制中心致病菌基因测序工作外包服务项目挂网议价(二次)公告(NDCDC2024004)

各潜在供应商:
宁德市疾病预防控制中心因工作需要采购致病菌基因测序工作外包服务，现拟采用挂网议价方式进行采购，具体要求如下：
一、采购项目：宁德市疾病预防控制中心致病菌基因测序工作外包服务项目。
二、采购数量：全基因组测序服务及菌种鉴定分析服务100份，单价600元/份，计60000元；宏基因组测序项目50份，单价800元/份，计40000元；
三、采购预算：10万元。
四、采购方式：在满足采购内容及要求（项号1-27）的情况下，采用低价评标法。
五、采购内容及要求：
（一）全基因组测序服务及菌种鉴定分析服务
1.样品接收：
配备专人负责样品的收集及运输，根据客户需求实时收取样品，样品需采用干冰进行运输，保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。（项号1）
2.实验室要求：
实验室搭载二代及三代测序技术平台，需具备自主测序平台和数据分析能力。实验室需通过ISO系列资质认证，有完备的质量管理流程和项目管理系统。有云平台分析系统。（项号2）
3.数据要求：
（1）交付数据包括原始数据（rawdata和cleandata，数据格式为fastq）及分析结果。（项号3）
（2）利用二代测序平台，文库长度在250~350bp之间，采用PE150（双端测序，单向读长150bp）及以上测序模式。（项号4）
（3）原始数据量（碱基数）≥1.2G，Q20高质量数据量（Clean data）≥1G，碱基数据质量值Q30比例≥85%。（项号5）
（4）覆盖度：碱基类型分布均匀，无GC分离；基因组10×覆盖度≥95%，基因区覆盖度≥98%，平均覆盖深度≥100×。（项号6）
（5）项目要求拼接后SCAFFOLD数量<100个，Contig数量<100个。（项号7）
（6）具体分析内容
二代测序质量评估和质控；基因组拼接；基因元件预测；基因功能注释；NR库比对注释；COG功能分类注释；GO功能分类注释；KEGG功能分类注释；毒力因子注释；耐药功能注释；碳水化合物活性酶注释；病原宿主互作用；信号肽蛋白预测；脂蛋白预测；蛋白亚细胞定位；基于16S rRNA的系统发育树；同源基因分析；泛基因组分析；基于同源基因的系统发育树；同源基因Cluster的功能；血清型分析。（项号8）
（7）下机数据能满足上传国家致病菌识别网数据需求。（项号9）
4.质控要求：
（1）每批样品收到后应立即开始质量检测等相应工作，核酸样品自收到之日起，于3-5日内提供样品质量检测报告。（项号10）
（2）核酸样品质量检测结果：浓度不低于5ng/μl、总量不低于100ng，无严重RNA污染，无明显降解。（项号11）
（3）样品质量检测合格，测序结果不合格的样品，服务商需免费加测直至成功。（项号12）
5.周期要求：
50个样本以内在14个工作日内完成，50-100个样本在20个工作日内完成，之后每增加50个样本，周期增加不超过5个工作日。（项号13）
6.数据交付及保存：
有专用的数据交付软件，能同时提供移动硬盘和网络下载的方式进行交付，网络下载方式数据下载期限不低于30天，测序下机后的原始数据服务商需保存一年。（项号14）
（二）宏基因组测序项目
1.样品接收：
配备专人负责样品的收集及运输，根据客户需求实时收取样品，样品需采用干冰进行运输，保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。（项号15）
2.实验室要求：
实验室搭载二代及三代测序技术平台，需具备自主测序平台和数据分析能力。实验室需通过ISO系列资质认证，有完备的质量管理流程和项目管理系统。有云平台分析系统。（项号16）
3.数据及分析要求：
（1）交付数据包括原始数据（rawdata和cleandata，数据格式为fastq）及分析结果。（项号17）
（2）利用二代测序平台，文库长度在250~350bp之间，采用PE150（双端测序，单向读长150bp）及以上测序模式。（项号18）
（3）原始数据量（碱基数）≥6G，碱基数据质量值Q30比例≥85%，Q20≥90%。（项号19）
（4）样本处理：由合适的Meta DNA提取试剂盒和处理方法获得合格的DNA样品。（项号20）
（5）文库构建：根据标准SOP建库流程完成文库构建。（项号21）
（6）生物信息学分析内容：原始数据处理，宏基因组组装、基因集构建、基因功能注释、基差异基因分析、物种注释与差异物种分析等。（项号22）
4.质控要求：
（1）每批样品收到后应立即开始质量检测等相应工作，核酸样品自收到之日起，于3-5日内提供样品质量检测报告。（项号23）
（2）核酸样品质量检测结果：浓度不低于5ng/μl、总量不低于100ng，无严重RNA污染，无明显降解。（项号24）
（3）样品质量检测合格，测序结果不合格的样品，服务商需免费加测直至成功。（项号25）
5.周期要求：
50个样本以内在20个工作日内完成，50-100个样本在30个工作日内完成，之后每增加50个样本，周期增加不超过5个工作日。
6.数据交付及保存：（项号26）
有专用的数据交付软件，能同时提供移动硬盘和网络下载的方式进行交付，网络下载方式数据下载期限不低于30天，测序下机后的原始数据服务商需保存一年。（项号27）
六、供应商资格要求（供应商资格条件）:
1.凡有能力提供本次议价文件所述服务（符合项号1-27）的，具有法人资格的国内供货商或制造商均可能成为合格的供应商。需提交以下资质证明文件：
（1）供应商的合格营业执照（三证合一）副本复印件；
（2）法定代表人身份证（正反面的复印件）；
（3）供应商代表人身份证（正反面的复印件），备注联系电话；
（4）法定代表人授权书原件(供应商代表是法定代表人无需)；
2.供应商对近三年无行贿犯罪记录进行声明(格式自拟)；3.供应商需提供参加政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明和通过“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）或中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）信用信息查询无严重违法失信行为信息记录的打印件（或截图）。
4.供应商近三年内未受到相关监管部门违规处罚、通报暂停、勒令整改、撤销服务证书等情况，提供承诺函并加盖供应商公章（格式自拟）。
5.供应商需提供财务状况报告，依法缴纳税收和社会保障资金的相关材料：
①财务状况报告：经审计2023年度的财务报告（包含资产负债表、利润表、现金流量表）,或其基本开户银行出具的资信证明；
②依法缴纳税收: 提供投标截止时间前六个月（不含投标截止时间的当月）已依法缴纳税收的投标人任意一个月的缴纳税收证明材料。
③社会保障资金的相关材料: 提供投标截止时间前六个月（不含投标截止时间的当月）中已依法缴纳税收的投标人任意一个月的缴交社会保障资金证明材料；
6.供应商具备履行合同所必需的设备和专业技术能力的证明材料
①具备履行合同所必需的设备：供应商提供办公场所的场地证明材料（属于自有产权的提供产权证复印件；非自有产权的提供场地租赁合同复印件，租赁期限不少于一年）；
②具备专业技术能力：提供负责本项目的主要人员的名单、联系电话及人员相关证书；
7.本项目不接受联合体投标。
注：以上相关资质证明文件应属法定有效期内的，若发生变更的，应按有关规定办理完变更手续后方可参加报价，并以发证机关核准的变更为准，否则按无效报价处理。其复印件应是清晰的并加盖供应商公章。
七、议价和响应文件时间及地点
（一）文件材料内容及顺序
1.报价函
2.货物说明一览表
3.资格证明文件（含“第五点 采购内容及要求”和“第六点 供应商资格要求”所涉及的资质证明材料）
4.投标人提交的其他资料
注：本次投标材料一式三份，正本一份，副本二份。
（二）投标文件的密封、标记和递交
1.投标文件要求独立编制:必须用A4幅面纸张打须胶装(永久性、无破坏不可拆分)装订成册，并每盖章，否则视为投标无效。
2.投标人应将投标文件（正本1份、副本2份）用信封密封，并标招标编号、投标货物名称。
3.每一密封信封上注明“于之(指投标邀请中规定的开标日期及时间)不准启封.
（三）文件响应递交时间：2024年8月14日至2024年8月16日(双休日及法定节假日除外)
（四）文件响应递交方式：请将相关文件材料于2024年8月16日下午6:00前送达接收点：宁德市疾病预防控制中心（蕉城区蕉城北路13号）4楼办公室王女士，联系电话：0593-2723758。